中央研究院 生物化學研究所

研究領域與專長

我們從事細菌生理學研究，課題包括細菌生長分裂與形態生成， 相關過程在生命週期中極為關鍵但脆弱，因此研究成果可能揭示防治細菌感染的潛在標的與策略的學理基礎。另一課題為探討影響宿主-病原菌交互作用中的細菌表面分子。簡介如下：

(1)代謝作用對細菌生長分裂的調節     
      細菌的生長和分裂狀態決定形態的生成，與代謝作用之間的協同可能是細胞生理上的固有特性，用以提高對生存環境的適應性。因此，我們研究代謝酵素與細胞生長和分裂之間在功能上的偶合現象。

(2)細菌細胞壁生合成與重塑     
      參與肽聚醣生合成的蛋白質複合體存在細胞膜環境中，其研究具有複雜度與挑戰性。我們運用細菌基因工程、定量蛋白體分析、和蛋白質生化等方法，來檢視複合體中的蛋白質組成與交互作用，找出具顯著性的新穎生理功能和交互作用蛋白。

(3)病原細菌進行胞內感染時的表面醣修飾     
      在這個研究課題中，我們研究李斯特菌進行胞內感染時表面的醣基化，如何與宿主細胞質中的半乳糖結合凝集素產生交互作用，影響宿主的防禦機制。

學經歷

• 1996 – 1999   博士, 生物化學系, 英國劍橋大學
• 1992 – 1994   碩士, 植物病蟲害學系, 國立臺灣大學
• 1988 – 1992   學士, 植物病蟲害學系, 國立臺灣大學

• 2014 – 迄今   副研究員, 中研院生化所
• 2006 – 2014   助研究員, 中研院生化所
• 2004 – 2006   講師, 美國康乃迪克大學健康中心分子生物微生物及結構生物學系
• 1999 – 2003   博士後研究, 美國康乃迪克大學健康中心分子生物微生物及結構生物學系

主要著作

Structure of the heterotrimeric membrane protein complex FtsB-FtsL-FtsQ of the bacterial divisome.   
Nguyen HTV, Chen X, Parada C, Luo AC, Shih O, Jeng US, Huang CY, Shih YL, Ma C   
Nature Communications (2023)

Harnessing Fluorescent Moenomycin A Antibiotics for Bacterial Cell Wall Imaging Studies.   
Hsieh PY, Meng FC, Guo CW, Hu KH, Shih YL, Cheng WC   
ChemBioChem (2021)

Active Transport of Membrane Components by Self-Organization of the Min Proteins.   
Shih YL, Huang LT, Tu YM, Lee BF, Bau YC, Hong CY, Lee HL, Shih YP, Hsu MF, Lu ZX, Chen JS, Chao L   
Biophysical Journal (2019)

Quantitative Proteomics Analysis Reveals the Min System of Escherichia coli Modulates Reversible Protein Association with the Inner Membrane.   
Lee HL, Chiang IC, Liang SY, Lee DY, Chang GD, Wang KY, Lin SY, Shih YL   
Molecular & Cellular Proteomics (2016)

Self-Assembly of MinE on the Membrane Underlies Formation of the MinE Ring to Sustain Function of the Escherichia coli Min System.   
Zheng M, Chiang YL, Lee HL, Kong LR, Hsu ST, Hwang IS, Rothfield LI and Shih YL   
J Biol Chem (2014)

Direct MinE-membrane interaction contributes to the proper localization of MinDE in E. coli.   
Hsieh CW, Lai HM, Lin CC, Lin TY, Hsieh TS, Shih YL   
Molecular Microbiology (2010)

著作列表