中央研究院 生物化學研究所

研究領域與專長

徐尚德博士為結構生物學家，致力於闡明蛋白質翻譯後修飾（PTMs）如何調控其結構、動態與功能。他的研究團隊結合高解析核磁共振光譜、冷凍電子顯微鏡與質譜分析，並運用人工智慧輔助建模，解析如醣基化與泛素化等修飾對蛋白質行為的分子調控機制。徐尚德實驗室著重於蛋白質結構與活性關聯的功能註解，並開發創新的分析與計算流程，以定量解析複雜蛋白質系統的構形與組成異質性。此跨領域研究結合化學、結構生物學與資料科學，建立理解翻譯後修飾如何協調細胞訊息傳遞與蛋白穩態的新框架，為分子調控機制與精準治療設計奠定基礎。

學經歷

• 2000 – 2004   博士, Bijvoet生物分子研究中心, 荷蘭烏特列支大學
• 1998 – 2000   碩士, 生命科學系, 清華大學
• 1994 – 1998   學士, 物理暨生命科學系雙主修, 清華大學

• 2022 – 迄今   副所長, 中央研究院生物化學所
• 2022 – 迄今   研究員, 中央研究院生物化學所
• 2017 – 2022   副研究員, 中央研究院生物化學所
• 2011 – 2017   助研究員, 中央研究院生物化學所
• 2010 – 2011   助理教授, 清華大學生物資訊及結構生物研究所
• 2009 – 2010   研究員, 英國劍橋大學化學系
• 2007 – 2010   研究院士, 英國劍橋大學Wolfson學院
• 2006 – 2008   國際人類前鋒科學計畫(Human Frontier Science Program)長期研究員, 英國劍橋大學化學系
• 2005 – 2006   荷蘭皇家科學院Ramsay研究員, 英國劍橋大學化學系
• 2004 – 2005   初級研究員, 荷蘭烏特列支大學化學系

主要著作

Structural basis of K11/K48-branched ubiquitin chain recognition by the human 26S proteasome.  
Draczkowski P, Chen SN, Chen T, Wang YS, Shih HA, Huang JYC, Tsai MC, Lin SY, Lin S, Viner R, Chang YC, Wu KP, Hsu STD*  
Nature Communications (2025)

Structural basis of enhanced stalling efficiency of an engineered ribosome arrest peptide.  
Sriramoju MK, Ko TP, Draczkowski P, Hsu STD*  
Nucleic Acids Research (2025)

Molecular basis of host recognition of human coronavirus 229E.  
Tsai YX, Chien YC, Hsu MF, Khoo KH, Hsu STD*  
Nature Communications (2025)

Rapid simulation of glycoprotein structures by grafting and steric exclusion of glycan conformer libraries.  
Tsai YX, Chang NE, Reuter K, Chang HT, Yang TJ, von Bülow S, Sehrawat V, Zerrouki M, Tuffery M, Gecht M, Grothaus IL, Ciacchi LC, Wang YS, Hsu MF, Khoo KH, Hummer G, Hsu STD*, Hanus C*, Sikora M*  
Cell (2024)

Structure, dynamics and stability of the smallest and most complex 7₁ protein knot. Highlighted by Google AlphaFold Impact Story  EN ver  中文版本 
Hsu MF, Sriramoju MK, Lai CH, Chen YR, Huang JS, Ko TP, Huang KF, Hsu STD*  
Journal of Biological Chemistry (2024)

In situ structure and dynamics of an alphacoronavirus spike protein by cryo-ET and cryo-EM.  
Huang CY, Draczkowski P, Wang YS, Chang CY, Chien YC, Cheng YH, Wu YM, Wang CH, Chang YC, Chang YC, Yang TJ, Tsai YX, Khoo KH, Chang HW, Hsu STD*  
Nature Communications (2022)

Tumor suppressor BAP1 nuclear import is governed by transportin-1.  
Yang TJ, Li TN, Huang RS, Pan MY, Lin SY, Lin S, Wu KP, Wang LH, Hsu STD*  
Journal of Cell Biology (2022)

D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein enhances viral fitness by desensitizing it to temperature-dependent denaturation.  
Yang TJ, Yu PY, Chang YC, Hsu STD*  
Journal of Biological Chemistry (2021)

Effect of SARS-CoV-2 B.1.1.7 mutations on spike protein structure and function.  
Yang TJ, Yu PY, Chang YC, Liang KH, Tso HC, Ho MR, Chen WY, Lin HT, Wu HC, Hsu STD*  
Nature Structural & Molecular Biology (2021)

Cryo-EM analysis of a feline coronavirus spike protein reveals a unique structure and camouflaging glycans.  
Yang TJ, Chang YC, Ko TP, Draczkowski P, Chien YC, Chang YC, Wu KP, Khoo KH, Chang HW*, Hsu STD*  
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2020)

著作列表