中央研究院 生物化學研究所

研究領域與專長

CRISPR-Cas9系統是一套高效率基因改造技術平台，對於基因研究應用在人類細胞、動物和植物帶來突破性大變革。此系統的重要核心Cas9核酸內切酶是利用短片段guide RNA辨識目標DNA序列，並切割DNA造成雙股斷裂。藉由 Cas9 進行的雙股DNA 切割，使基因體定㸃斷裂，進而啟動細胞修補機制。CRISPR-Cas9技術不僅能達成定㸃基因剔除, 剔入和基因修飾的目的，也開啟基因治療的契機。我們實驗室將發展更具有效率、精確和安全的CRISPR-Cas9系統，應用於人類基因組編輯。目前，我們的研究方向分為下列幾項：

1. 利用基因編輯增進人類自然殺手細胞以及改善免疫細胞療法的策略。
2. 開發免疫細胞專用的腺病毒技術以增加DNA傳送效率和基因植入效率。
3. 了解CRISPR-Cas切割基因體造成的DNA雙股斷裂和修復，進而增進基因編輯效率和精確度。

學經歷

• 2006 – 2012   博士, 微生物系, 伊利諾大學香檳分校, 美國
• 2004 – 2006   碩士, 生化系, 俄亥俄州立大學, 美國
• 1996 – 2001   學士, 生物系, 英屬哥倫比亞大學, 加拿大

• 2024 – 迄今   副研究員, 中央研究院生物化學研究所
• 2016 – 2024   助研究員, 中央研究院生物化學研究所
• 2012 – 2015   博士後研究員, Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, USA
• 2004 – 2004   研究助理, Department of Biochemistry, The Ohio State University, USA
• 2001 – 2003   研究助理, 中央研究院化學研究所

主要著作

Genome-wide CRISPR screens in primary human natural killer cells identify countermeasures against immunosuppressive environment.
Nguyen QV, Lan YJ, Chang JC, Shih HA, Faustine J, Chen CC, Ho SY, Cheng CW, Chao TL, Lin S*
Nat Commun. (2026)

Epigenetic modulation elicits an NK cell-mediated immune response in urothelial carcinoma.
Kumari H, Chen CN, Shih HA, Yeh CC, Tseng TY, Tsai HF, Low JT, Chan CP, Lin GL, Huang WH, Yao CL, Lin S, Shen CH, Chan MWY
Mol Med. (2025)

Structural basis of K11/K48-branched ubiquitin chain recognition by the human 26S proteasome.
Draczkowski P, Chen SN, Chen T, Wang YS, Shih HA, Huang JYC, Tsai MC, Lin SY, Lin S, Viner R, Chang YC, Wu KP, Hsu SD
Nat Commun. (2025)

Interrogation of human microglial phagocytosis by CRISPR genome editing.
Chang JC, Wang CY, Lin S*
Front Immunol. (2023)

Tumor suppressor BAP1 nuclear import is governed by transportin-1.
Yang TJ, Li TN, Huang RS, Pan MY, Lin SY, Lin S, Wu KP, Wang LH, Hsu SD
J Cell Biol. (2022)

Ex Vivo Expansion and CRISPR-Cas9 Genome Editing of Primary Human Natural Killer Cells.
Huang RS, Lai MC, Lin S*
Curr Protoc. (2021)

A robust platform for expansion and genome editing of primary human natural killer cells.
Huang RS, Lai MC, Shih HA, Lin S*
J Exp Med. (2021)

Humanized COVID-19 decoy antibody effectively blocks viral entry and prevents SARS-CoV-2 infection.
Huang KY, Lin MS, Kuo TC, Chen CL, Lin CC, Chou YC, Chao TL, Pang YH, Kao HC, Huang RS, Lin S, Chang SY, Yang PC
EMBO Mol Med. (2021)

Hsc70/Stub1 promotes the removal of individual oxidatively stressed peroxisomes. 
Chen BH, Chang YJ, Lin S, Yang WY 
Nat Commun. (2020)

A multiplexed bioluminescent reporter for sensitive and non-invasive tracking of DNA double strand break repair dynamics in vitro and in vivo. 
Chien JC, Tabet E, Pinkham K, da Hora CC, Chang JC, Lin S, Badr CE, Lai CP 
Nucleic acids research (2020)

Enhanced NK-92 Cytotoxicity by CRISPR Genome Engineering Using Cas9 Ribonucleoproteins. 
Huang RS, Shih HA, Lai MC, Chang YJ, Lin S* 
Frontiers in Immunology (2020)

TIM-mediated inhibition of HIV-1 release is antagonized by Nef but potentiated by SERINC proteins. 
Li M, Waheed AA, Yu J, Zeng C, Chen HY, Zheng YM, Feizpour A, Reinhard BM, Gummuluru S, Lin S, Freed EO, Liu SL
Proc Natl Acad Sci USA. (2019)

Biosynthesis of Complex Indole Alkaloids: Elucidation of the Concise Pathway of Okaramines. 
Lai CY, Lo IW, Hewage RT, Chen YC, Chen CT, Lee CF, Lin S, Tang MC, Lin HC
Angew Chem Int Ed Engl. (2017)

著作列表