研究領域與專長

實驗室之研究方向為使用適合的分子生物、生物化學、生物物理、生物資訊、乃至於電子顯微鏡等方法,來探討具功能性巨大分子之組成,以及其結構與功能的關聯性。

就治療因為不正常細胞而引發的疾病而言,能了解其在分子層次上之表觀遺傳(epigenetics)的過程是一項很重要的資訊。而所謂的表觀遺傳,它包括了去氧核糖核酸(DNA)、組織蛋白(histone)以及其他染色質相關蛋白質的轉譯後修飾及調節。表觀遺傳會影響染色質的結構,也因此而參與了基因表現的調控。在我們早先的研究工作中,我們發現了一個組織蛋白去乙醯基化(histone deacetylation)的產物,叫做 AAR(O-acetyl-ADP-ribose),它會影響到基因靜默訊息調節者(Silencing Information Regulator, SIR) 蛋白質複合體的stoichiometry,並且會引發此蛋白質複合體的結構變化,同時也與異染色質(hetrochromatin)結構有密切關聯性。使用全基因體式(genome-wide)的篩選策略,我們發現到SET3蛋白質複合體很可能是另一個與AAR 會有交互作用的蛋白質複合體。SET3蛋白質複合體是由七種不同的蛋白質所組成,他們是Set3、Sif2、Snt1、Hos4、Cpr1以及名為Hos2 和Hst1的兩種組織蛋白去乙醯基酶。

為了透徹瞭解SET3蛋白質複合體結構與功能之間的關聯性,目前我們將繼續研究完成各個SET3蛋白質複合體的組成蛋白質之間的交互作用,以及它們分別與組織蛋白之間的交互作用。之後,我將使用適合的分子生物、生物化學、生物物理,包括電子顯微鏡的方法,例如: 單一粒子重建(single particle reconstitution) 去解析出SET3蛋白質複合體的三維立體結構,乃至於它與nucleosome結合的三維立體結構。同時也計畫將來將更進一步的使用單層結晶(monolayer crystallization) 的技術,來得到結晶蛋白質、蛋白質複合體的結晶結構,甚至於建構出一個組裝特定蛋白質複合體的模擬平台。此外更計畫使用結合染色質免疫沉澱(Chromatin immunoprecipitation, ChIP)和次世代定序(Next generation sequencing, NGS),以及染色體原位雜交(in situ hybridization)等方法,來對SET3蛋白質複合體在整個基因組調控位置上作定位的分析研究。

這種結合了生體內定位,生體外重組和電子顯微鏡結構生物學的研究方法,將可以更進一步的瞭解SET3蛋白質複合體,乃至於SET3蛋白質複合體和nucleosome 間,結構與功能之間的關聯性。同時,也提供一個新的檢測方法去瞭解特定染色質結構的形成,以及其在調控基因表現上所扮演的角色。

學經歷
經歷
  • 2017 – 迄今   客座助理教授, 中央研究院生物化學研究所
  • 2017 – 迄今   客座助理教授, 大葉大學生物產業科技學系
  • 2014 – 2017   客座助理教授, 中央研究院分子生物研究所
  • 2011 – 2015   兼任助理教授, 國立台灣大學分子與細胞研究所
  • 2009 – 2014   兼任助理教授, 國立中興大學生物技術中心
  • 2008 – 2014   兼任助理教授, 中國醫藥大學基礎醫學研究所
  • 2006 – 2014   助研究員, 國家衛生研究院分子與基因研究所
  • 2002 – 2006   博士後研究員, 哈佛大學醫學院
學歷
  • 2001   博士, 分子醫學研究所, 國立台灣大學
主要著作
Tung S-Y, Wang S-H, Lee S-P, Tsai S-P, Shen H-H, Chen F-J, Wu Y-Y, Hsiao S-P, Liou G-G
Mol Biol Cell. (2017)
Lo Y-L, Liou G-G, Lyu J-H, Hsiao M, Hsu T-L, Wong C-H.
PLoS One (2016)
Chen T-H, Chen M-R, Chen T-Y, Wu T-C, Liu S-W, Hsu C-H, Liou G-G, Kao Y-Y, Dong G-C, Chu P-H, Liao J-W, Lin K-M.
Oncotarget (2016)
Shen K-Y, Liu H-Y, Li H-J, Wu C-C, Liou G-G, Chang Y-C, Leng C-H, Liu S-J.
J Control Release. (2016)
Chen Y-W, Liou G-G, Pan H-B, Tseng H-H, Hung Y-T, Chou C-P.
Int. J. Nanomedicine. (2015)
Chung S-Y, Kao C-H, Villarroya F, Chang H-Y, Chang H-C, Hsiao S-P, Liou G-G, Chen S-L.
Mol Cell Biol. (2015)
Wang Y-L, Liou G-G, Lin C-H, Chen M-L, Kuo T-M, Tsai K-N, Huang C-C, Chen Y-L, Huang L-R, Chou Y-C, Chang C.
PLoS One (2015)
Wu S-L, Li G-Z, Chou C-Y, Tsai M-S, Chen Y-P, Li C-J, Liou G-G, Chang W-W, Chen S-L, Wang S-H.
Cell Tissue Res. (2014)
Tung S-Y, Tsai H-C, Shen H-H, Tsai S-P, Lee S-P, Hsiao S-P, Chen F-J, Liou G-G.
Austin J. Comput. Biol. Bioinform. (2014)
Chen Z-J, Wang W-P, Chen Y-C, Wang J-Y, Lin W-H, Tai L-A, Liou G-G, Yang C-S, Chi Y-H.
J. Cell Sci. (2014)

實驗室之研究方向為使用適合的分子生物、生物化學、生物物理、生物資訊、乃至於電子顯微鏡等方法,來探討具功能性巨大分子之組成,以及其結構與功能的關聯性。

就治療因為不正常細胞而引發的疾病而言,能了解其在分子層次上之表觀遺傳(epigenetics)的過程是一項很重要的資訊。而所謂的表觀遺傳,它包括了去氧核糖核酸(DNA)、組織蛋白(histone)以及其他染色質相關蛋白質的轉譯後修飾及調節。表觀遺傳會影響染色質的結構,也因此而參與了基因表現的調控。在我們早先的研究工作中,我們發現了一個組織蛋白去乙醯基化(histone deacetylation)的產物,叫做 AAR(O-acetyl-ADP-ribose),它會影響到基因靜默訊息調節者(Silencing Information Regulator, SIR) 蛋白質複合體的stoichiometry,並且會引發此蛋白質複合體的結構變化,同時也與異染色質(hetrochromatin)結構有密切關聯性。使用全基因體式(genome-wide)的篩選策略,我們發現到SET3蛋白質複合體很可能是另一個與AAR 會有交互作用的蛋白質複合體。SET3蛋白質複合體是由七種不同的蛋白質所組成,他們是Set3、Sif2、Snt1、Hos4、Cpr1以及名為Hos2 和Hst1的兩種組織蛋白去乙醯基酶。

為了透徹瞭解SET3蛋白質複合體結構與功能之間的關聯性,目前我們將繼續研究完成各個SET3蛋白質複合體的組成蛋白質之間的交互作用,以及它們分別與組織蛋白之間的交互作用。之後,我將使用適合的分子生物、生物化學、生物物理,包括電子顯微鏡的方法,例如: 單一粒子重建(single particle reconstitution) 去解析出SET3蛋白質複合體的三維立體結構,乃至於它與nucleosome結合的三維立體結構。同時也計畫將來將更進一步的使用單層結晶(monolayer crystallization) 的技術,來得到結晶蛋白質、蛋白質複合體的結晶結構,甚至於建構出一個組裝特定蛋白質複合體的模擬平台。此外更計畫使用結合染色質免疫沉澱(Chromatin immunoprecipitation, ChIP)和次世代定序(Next generation sequencing, NGS),以及染色體原位雜交(in situ hybridization)等方法,來對SET3蛋白質複合體在整個基因組調控位置上作定位的分析研究。

這種結合了生體內定位,生體外重組和電子顯微鏡結構生物學的研究方法,將可以更進一步的瞭解SET3蛋白質複合體,乃至於SET3蛋白質複合體和nucleosome 間,結構與功能之間的關聯性。同時,也提供一個新的檢測方法去瞭解特定染色質結構的形成,以及其在調控基因表現上所扮演的角色。

經歷
  • 2017 – 迄今   客座助理教授, 中央研究院生物化學研究所
  • 2017 – 迄今   客座助理教授, 大葉大學生物產業科技學系
  • 2014 – 2017   客座助理教授, 中央研究院分子生物研究所
  • 2011 – 2015   兼任助理教授, 國立台灣大學分子與細胞研究所
  • 2009 – 2014   兼任助理教授, 國立中興大學生物技術中心
  • 2008 – 2014   兼任助理教授, 中國醫藥大學基礎醫學研究所
  • 2006 – 2014   助研究員, 國家衛生研究院分子與基因研究所
  • 2002 – 2006   博士後研究員, 哈佛大學醫學院
學歷
  • 2001   博士, 分子醫學研究所, 國立台灣大學
Tung S-Y, Wang S-H, Lee S-P, Tsai S-P, Shen H-H, Chen F-J, Wu Y-Y, Hsiao S-P, Liou G-G
Mol Biol Cell. (2017)
Lo Y-L, Liou G-G, Lyu J-H, Hsiao M, Hsu T-L, Wong C-H.
PLoS One (2016)
Chen T-H, Chen M-R, Chen T-Y, Wu T-C, Liu S-W, Hsu C-H, Liou G-G, Kao Y-Y, Dong G-C, Chu P-H, Liao J-W, Lin K-M.
Oncotarget (2016)
Shen K-Y, Liu H-Y, Li H-J, Wu C-C, Liou G-G, Chang Y-C, Leng C-H, Liu S-J.
J Control Release. (2016)
Chen Y-W, Liou G-G, Pan H-B, Tseng H-H, Hung Y-T, Chou C-P.
Int. J. Nanomedicine. (2015)
Chung S-Y, Kao C-H, Villarroya F, Chang H-Y, Chang H-C, Hsiao S-P, Liou G-G, Chen S-L.
Mol Cell Biol. (2015)
Wang Y-L, Liou G-G, Lin C-H, Chen M-L, Kuo T-M, Tsai K-N, Huang C-C, Chen Y-L, Huang L-R, Chou Y-C, Chang C.
PLoS One (2015)
Wu S-L, Li G-Z, Chou C-Y, Tsai M-S, Chen Y-P, Li C-J, Liou G-G, Chang W-W, Chen S-L, Wang S-H.
Cell Tissue Res. (2014)
Tung S-Y, Tsai H-C, Shen H-H, Tsai S-P, Lee S-P, Hsiao S-P, Chen F-J, Liou G-G.
Austin J. Comput. Biol. Bioinform. (2014)
Chen Z-J, Wang W-P, Chen Y-C, Wang J-Y, Lin W-H, Tai L-A, Liou G-G, Yang C-S, Chi Y-H.
J. Cell Sci. (2014)